Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia4B8QI36 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ppfia4B8QI36 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms