Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Sh3bp5Q9Z131 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Sh3bp5Q9Z131 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Sh3bp5Q9Z131 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Sh3bp5Q9Z131 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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