Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms