Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms