Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms