Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Derl3Q9D8K3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms