Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb6Q922F4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms