Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc3Q8CFZ4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms