Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ChfrQ810L3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ChfrQ810L3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ChfrQ810L3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ChfrQ810L3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ChfrQ810L3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ChfrQ810L3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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