Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cachd1Q6PDJ1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cachd1Q6PDJ1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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