Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Gja3Q64448 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja3Q64448 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms