Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myh1Q5SX40 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms