Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx2P81066 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx2P81066 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx2P81066 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx2P81066 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms