Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NrlP54846 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NrlP54846 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrlP54846 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrlP54846 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NrlP54846 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NrlP54846 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NrlP54846 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NrlP54846 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NrlP54846 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NrlP54846 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NrlP54846 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms