Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT1P26358 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms