Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms