Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffaO54786 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffaO54786 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffaO54786 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffaO54786 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DffaO54786 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DffaO54786 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DffaO54786 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DffaO54786 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DffaO54786 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DffaO54786 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms