Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CRXO43186 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CRXO43186 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CRXO43186 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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