Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms