Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snai3Q9QY31 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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