Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms