Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trem1Q9JKE2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms