Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms