Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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