Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp2Q9CQ73 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms