Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms