Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NfascQ810U3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms