Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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