Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms