Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms