Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc9Q3V038 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms