Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Kdm4dQ3U2K5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms