Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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RYR3Q15413 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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RYR3Q15413 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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RYR3Q15413 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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RYR3Q15413 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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