Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1SQ13698 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms