Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms