Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF3P18847 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF3P18847 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF3P18847 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF3P18847 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF3P18847 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATF3P18847 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATF3P18847 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ATF3P18847 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF3P18847 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF3P18847 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF3P18847 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF3P18847 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF3P18847 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF3P18847 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF3P18847 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF3P18847 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF3P18847 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF3P18847 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF3P18847 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF3P18847 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF3P18847 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF3P18847 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF3P18847 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF3P18847 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF3P18847 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF3P18847 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF3P18847 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF3P18847 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF3P18847 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF3P18847 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF3P18847 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF3P18847 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF3P18847 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF3P18847 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF3P18847 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF3P18847 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF3P18847 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF3P18847 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF3P18847 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF3P18847 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF3P18847 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF3P18847 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF3P18847 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF3P18847 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF3P18847 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF3P18847 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF3P18847 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms