Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RLBP1P12271 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms