Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LtaP09225 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LtaP09225 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtaP09225 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtaP09225 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtaP09225 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtaP09225 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtaP09225 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtaP09225 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtaP09225 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtaP09225 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtaP09225 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtaP09225 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LtaP09225 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LtaP09225 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LtaP09225 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LtaP09225 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LtaP09225 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LtaP09225 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LtaP09225 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LtaP09225 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtaP09225 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LtaP09225 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtaP09225 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtaP09225 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtaP09225 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtaP09225 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtaP09225 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtaP09225 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtaP09225 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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LtaP09225 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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LtaP09225 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtaP09225 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtaP09225 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtaP09225 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtaP09225 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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LtaP09225 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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LtaP09225 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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LtaP09225 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtaP09225 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtaP09225 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtaP09225 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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LtaP09225 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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LtaP09225 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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LtaP09225 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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LtaP09225 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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LtaP09225 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtaP09225 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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