Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja1O55176 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms