Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms