Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlr5Q9JLF7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlr5Q9JLF7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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