Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GOPCQ9HD26 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOPCQ9HD26 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms