Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phc3Q8CHP6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Phc3Q8CHP6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Phc3Q8CHP6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Phc3Q8CHP6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Phc3Q8CHP6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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