Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms