Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms