Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms