Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Znf260Q62513 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Znf260Q62513 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Znf260Q62513 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Znf260Q62513 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Znf260Q62513 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Znf260Q62513 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Znf260Q62513 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.7 ms