Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms