Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNIP1Q15025 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms