Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnma1Q08460 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms